ID SNP | Valore PIC |
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Il contenuto informativo dei polimorfismi (PIC) per un SNP con frequenze alleliche note è stato calcolato con la seguente formula:
PIC = 1 - ∑i pi2 - ∑i ∑j>i 2 * pi2 * pj2
Dove:
- pi è la frequenza di ciascun allele.
- Il primo termine rappresenta la somma dei quadrati delle frequenze alleliche.
- Il secondo termine rappresenta la somma di tutti i prodotti incrociati per l'informatività.
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Simbolo | Nome Completo |
---|---|
A | Adenina |
C | Citosina |
G | Guanina |
T | Timina |
U | Uracile |
R | Guanina / Adenina (purine) |
Y | Citosina / Timina (pirimidine) |
K | Guanina / Timina |
M | Adenina / Citosina |
S | Guanina / Citosina |
W | Adenina / Timina |
B | Guanina / Timina / Citosina |
D | Guanina / Adenina / Timina |
H | Adenina / Citosina / Timina |
V | Guanina / Citosina / Adenina |
N | Adenina / Guanina / Citosina / Timina |