Stringa genotipi
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In questa sezione puoi inserire stringhe di genotipi
(loci SNP concatenati ordinati per cromosoma e posizione)
per calcolare la distanza genetica tra
nuove accessioni e quelle già genotipizzate.
La stringa deve essere composta esattamente da 38 residui, in caso di mancanza di dati per uno o più loci specifici indicare tali dati mancanti con la lettera "N".
Questo permette di distinguere chiaramente tra un'assenza di informazione e un allele effettivamente identificato
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Simboli dei Nucleotidi
| Simbolo | Nome Completo |
|---|---|
| A | Adenina |
| C | Citosina |
| G | Guanina |
| T | Timina |
| U | Uracile |
| R | Guanina / Adenina (purine) |
| Y | Citosina / Timina (pirimidine) |
| K | Guanina / Timina |
| M | Adenina / Citosina |
| S | Guanina / Citosina |
| W | Adenina / Timina |
| B | Guanina / Timina / Citosina |
| D | Guanina / Adenina / Timina |
| H | Adenina / Citosina / Timina |
| V | Guanina / Citosina / Adenina |
| N | Adenina / Guanina / Citosina / Timina |